Określone długości krawędzi w siecix/igraph (Python)

Question

Chciałem wizualizować sieć z posiadanymi danymi i chciałbym je wyrysować przy określonych długościach krawędzi. Używam Pythona i próbowałem networkx i igraph, ale wszystkie wydają się przypisywać stałe długości krawędzi.

a.) Zastanawiam się, czy zrobiłem źle kody lub pakiety nie są naprawdę zdolne. Jak prawidłowo zaimplementować określone długości krawędzi dla networkx lub igraph?

b.) Jeśli siećx i igraph nie mogą tego zrobić, jaki pakiet mógłbyś zasugerować? (Najlepiej taki, który może przenosić ponad 80 tysięcy węzłów).

Dzięki!

Answer 1

ta powinna działać:

import networkx as NX 
import pygraphviz as PG 

G = PG.AGraph() 
nlist = "A B C D E".split() 
a, b = "A A B", "B C D" 
elist = zip(a.split(), b.split()) 

G.add_nodes_from(nlist) 
G.add_edges_from(elist) 
G.node_attr.update(color="red", style="filled") 
G.edge_attr.update(color="blue", len="2.0", width="2.0") 

print(G.edge_attr) 
# returns {'color': 'red', 'width': '', 'len': '2.0'} 

# add new edge with custom length (all others have length=2.0): 
G.add_edge("C", "E", len="3.0", color="blue", width="2.0") 

edge = G.get_edge("C", "E") 
print(edge_attr) 
# returns {'color': 'blue', 'width': '2.0', 'len': '3.0'} 

# and you can confirm that introspection by drawing & printing this graph: 
G.draw('somefolderandfilename.png', format='png', prog='neato') 

Większość algorytmów wykres rysunkowe pewną wersję SMACOF, które oczywiście różni się na długości krawędzi; jednak silnik układu graficznego "neato" (dostarczany jako drugi argument do "narysowania" powyżej) powinien zachować, jeśli w ogóle możliwe, ustawione przez użytkownika długości krawędzi.

Biblioteka, której tu użyłem, jest z pewnością wystarczająco wytrzymała, aby obsłużyć 80 000 węzłów.