Jak uzyskać dostęp do zmiennej środowiskowej bash z poziomu R w emacs-ESS

Question

W moim .bashrc, mam linię:

export SETTINGS=/home/user/settings.xml 

Gdybym załadować R w bash, można uzyskać dostęp do tej zmiennej za pomocą funkcji Sys.getenv :

Sys.getenv("SETTINGS") 
"/home/user/settings.xml" 

Gdybym otworzyć R w Emacs (MX R), ustawień jest pusty:

Sys.getenv("SETTINGS") 
"" 

Co próbowałem:

1. dodanie następujących do .emacs na podstawie How do I make Emacs recognize bash environment variables for compilation?

   ;; get environment vars from .bashrc 
   (let ((path (shell-command-to-string ". ~/.bashrc; echo -n $SETTINGS"))) 
       (setenv "SETTINGS" path)) 
   

2. otwarcia wybić otwór emacsie pomocą M-x term

   echo $SETTINGS   # works 
   R 
   Sys.getenv("SETTINGS") #works 
   

3. Jeśli otworzyć emacsowi z terminala ustawienia zmienna jest dostępna zgodnie z oczekiwaniami. Otwieranie emacs z menu Aplikacje (z komendą /usr/bin/emacs23 %F lub emacs) nie działa.

4. porównywaniu wyników z session("env") podczas ładowania R w bash vs emacs, ale nic nie stoi na inny niż (bash = <, emacs =>):

   > INSIDE_EMACS=23.3.1,comint 
   6d5 
   < SETTINGS=/home/user/settings.xml 
   9c8 
   < SHLVL=1 
   > SHLVL=0 
   14a14 
   > PAGER=cat 
   16d15 
   < PAGER=/usr/bin/pager 
   19d17 
   < COLORTERM=gnome-terminal 
   25c23 
   < WINDOWID=14680069 
   > DESKTOP_AUTOSTART_ID=1020ce948b944a88113395253627645060000001863000 
   < TERM=xterm 
   > TERM=dumb 
   

mogę albo

1. dostęp do ustawień z poziomu R w emacs-ess
2. eksportuj ustawienia, gdzie mogę uzyskać do niego dostęp?

Answer 1

Nie wiem o R i zdefiniowanych przez siebie zmiennych środowiskowych, ale ustawiam zmienną PATH w emacs na taką samą wartość jak w moim bashrc. Zmodyfikowałem swój kod na twój problem, daj mu szansę i daj mi znać, czy to działa.

;; set env variable in Emacs 
(getenv "SETTINGS") 
(setenv "SETTINGS" "/home/user/settings.xml") 

kod oryginalny (dla ścieżki) jest:

;; Emacs has its own path variable 
(getenv "PATH") 
(setenv "PATH" 
(concat 
"/usr/local/texlive/2011/bin/x86_64-linux" ":" 
(getenv "PATH"))) 

Answer 2

Jeśli zacznie Ci sesję R wewnątrz emacs, sesja R będzie miał takie same zmienne środowiskowe jak emacs. Dlatego powinieneś najpierw upewnić się, że uruchamiasz emacs w taki sposób, że jego środowisko zawiera zmienną SETTINGS. W ten sposób twoja sesja R, która rozpocznie się w emacs, będzie miała ustawienia w swoim środowisku. Jak dokładnie to osiągnąć, zależy od twojego systemu.

Answer 3

.Bashrc może nie zostać odczytany po uruchomieniu Xsession. Spróbuj dodać

export SETTINGS=/home/user/settings.xml 

w .xsessionrc lub .gnomerc (jeśli używasz gnome). Te pliki są ładowane przy starcie dla sesji X.

Answer 4

Można umieścić

SETTINGS <- "/home/user/settings.xml" 

w .Rprofile jako obejście.