Animowanie wzrostu sieci za pomocą NetworkX i Matplotlib

Question

Chciałbym animować wykres, który rośnie z upływem czasu.

To, co mam tak daleko:

fig = plt.figure() 
ims = [] 
graph = nx.Graph() 
for i in range(50): 
    // Code to modify Graph 
    nx.draw(graph, pos=nx.get_node_attributes(graph,'Position')) 
    im = plt.draw() 
    self.ims.append([im]) 
ani = animation.ArtistAnimation(fig, ims, interval=50, blit=True,repeat_delay=1000) 
ani.save('dynamic_images.mp4') 
plt.show() 

jednak, pojawia się następujący komunikat o błędzie:

File "main.py", line 204, in <module> 
    repeat_delay=1000) 
    File "/usr/lib/pymodules/python2.7/matplotlib/animation.py", line 356, in __init__ 
    TimedAnimation.__init__(self, fig, *args, **kwargs) 
    File "/usr/lib/pymodules/python2.7/matplotlib/animation.py", line 304, in __init__ 
    Animation.__init__(self, fig, event_source=event_source, *args, **kwargs) 
    File "/usr/lib/pymodules/python2.7/matplotlib/animation.py", line 53, in __init__ 
    self._init_draw() 
    File "/usr/lib/pymodules/python2.7/matplotlib/animation.py", line 363, in _init_draw 
    artist.set_visible(False) 
AttributeError: 'NoneType' object has no attribute 'set_visible' 
nicomoto@nicomoto-VirtualBox:~/Desktop/CS8903-SpecialProblem/Code/ 

Co chcę jest animacja, gdzie można zobaczyć wykres rośnie. Mogę zapisać wykres na każdym etapie i może być w stanie stworzyć animację poza matplotlib, ale czy jest jakiś sposób na to, aby działał w ten sposób?

Answer 1

Po sprawdzeniu ten kod nie był tak istotny dla tego problemu, jak myślałem. Jednak udało mi się użyć this SO answer i this SO answer, aby zebrać odpowiedź dla Ciebie. Oto kod, który utworzy wykres, doda 50 losowych węzłów i 50 losowych krawędzi do niego i wyświetli obraz wykresu po dodaniu każdego węzła i krawędzi. Kilka z kluczowych zmian od kodu:

1. Kod ten jest oparty na wykorzystaniu pylab.ion() (patrz here aby uzyskać więcej informacji).
2. Twój kod próbuje użyć jednej cyfry i zmienić obraz w niej. Ten kod tworzy nową liczbę dla każdej ramki.
3. Ten kod nie jest zapisywany w .mp4. Jeśli naprawdę musisz to zrobić, sugerowałbym zapisanie liczb do pliku .png podczas renderowania i konwertowanie do MP4 po fakcie.
4. Należy zauważyć, że ten kod używa matplotlib.pyplot.pause() zamiast time.sleep(). Liczby nie będą wyświetlane, jeśli użyjesz time.sleep().

Powodzenia!

import random 
import pylab 
from matplotlib.pyplot import pause 
import networkx as nx 
pylab.ion() 

graph = nx.Graph() 
node_number = 0 
graph.add_node(node_number, Position=(random.randrange(0, 100), random.randrange(0, 100))) 

def get_fig(): 
    global node_number 
    node_number += 1 
    graph.add_node(node_number, Position=(random.randrange(0, 100), random.randrange(0, 100))) 
    graph.add_edge(node_number, random.choice(graph.nodes())) 
    fig = pylab.figure() 
    nx.draw(graph, pos=nx.get_node_attributes(graph,'Position')) 
    return fig 

num_plots = 50; 
pylab.show() 

for i in range(num_plots): 

    fig = get_fig() 
    fig.canvas.draw() 
    pylab.draw() 
    pause(2) 
    pylab.close(fig) 

Answer 2

Udoskonalona wersja bretlance. Mam nadzieję, że będzie to pomocne. Pokaże animacje ale nie zdjęcie po zdjęciu.

Nadal nie wiem jak właściciel pytanie Animate drawing networkx edges skorzystał z matplotlib w animacji

#!/usr/bin/env python 
import random 
import pylab 
from matplotlib.pyplot import pause 
import networkx as nx 
pylab.ion() 

graph = nx.Graph() 
node_number = 0 
graph.add_node(node_number, Position=(random.randrange(0, 100), random.randrange(0, 100))) 

def get_fig(): 
    global node_number 
    node_number += 1 
    graph.add_node(node_number, Position=(random.randrange(0, 100), random.randrange(0, 100))) 
    graph.add_edge(node_number, random.choice(graph.nodes())) 
    nx.draw(graph, pos=nx.get_node_attributes(graph,'Position')) 

num_plots = 50; 
pylab.show() 

for i in range(num_plots): 

    get_fig() 
    pylab.draw() 
    pause(2)