komunikatami w Knitr/Rmarkdown

Question

Oto kod dla mojego pliku RMarkdown:

```{r echo=FALSE, message=FALSE} 
opts_chunk$set(comment = NA, echo=FALSE, message = FALSE, warnings = FALSE) 
options("getSymbols.warning4.0"=FALSE) 
Sys.setenv(TZ = "GMT") 
library(quantmod) 
library(xtable) 
library(PerformanceAnalytics) 
``` 

```{r} 
getSymbols("^RUT") 
chart.TimeSeries(RUT) 
dev.off() 
``` 

Pomimo ustawienia message = FALSE, warnings = FALSE, ja wciąż otrzymuję komunikaty wyjściowe w pliku HTML, gdy biegnę getSymbols() i dev.off(). Ich odpowiednie wyjścia są:

[1] "RUT" 

i

null device 
      1 

Jak tłumić te wiadomości?

Answer 1

Spróbuj użyć polecenia invisible, aby wyłączyć te typy danych wyjściowych.

```{r} 
invisible(getSymbols("^RUT")) 
chart.TimeSeries(RUT) 
invisible(dev.off()) 
``` 

Od strony pomocy dla ?invisible:

Funkcja ta może być przydatna, gdy pożądane jest, aby mieć funkcje zwracają wartości, które mogą być przypisane, ale które nie są drukowane, gdy nie są one przypisane.

Żadne z nich nie jest "komunikatem" lub "ostrzeżeniem", ale rzeczywistymi wartościami wyjściowymi. Zobaczysz, że wartości dla są w rzeczywistości tłumione przez knitr na wyjściu.

Answer 2

Nigdy nie powinieneś używać dev.off() podczas korzystania z knitr. Dba o to, aby wszystkie urządzenia tworzyły wątki.

Od autora pakietu Yihui

null device 
      1 

jest wyjście dev.off().

Być może getSymbols powraca czymś danym, które nie zostały zdefiniowane env

Jeśli chcesz ukryć wyniki (output) (w ogóle) można użyć results = 'hide' jako opcja. Nie ma potrzeby, aby zawinąć coś w invisible()

Answer 3

wpadł na ten problem, a także, chciałbym dodać, że powinna ona być warning = FALSE, nie warnings = FALSE