2012-04-14 16 views
5

Chciałbym przekazać prawą stronę formuły do ​​funkcji R, która następnie "dodaje" lewą stronę formuły i wywołuje gam(). Chciałbym to osiągnąć bez brzydkich konstrukcji .formula() itp.Jak przekazać prawą stronę formuły do ​​innej formuły?

Utknąłem w następującym minimalnym przykładzie, czy wiesz, co poszło nie tak?

require(mgcv) 
set.seed(0) ## set.seed(1) 
gamEx1 <- gamSim(1, n=400, dist="normal", scale=2) ## simulate some data 
str(gamEx1) ## display structure 

## calling gam() and passing the right-hand side of a formula 
gamFitter <- function(formula.RHS, data, ...){ 
    z <- 2*data$y + data$f0 # some given values 
    gam(z ~ formula.RHS, data=data, ...) # call gam() 
} 

## call the function with the right-hand side of a formula 
gamFitter(formula.RHS=~s(x0)+s(x1)+s(x2)+s(x3), data=gamEx1) 

Error in model.frame.default(formula = z ~ formula.RHS, data = data, 
          drop.unused.levels = TRUE) : 
    invalid type (language) for variable 'formula.RHS' 

Odpowiedz

12

Wydaje że powinieneś użyć wbudowanej funkcjonalności R, na Mely update.formula, nie ma potrzeby, aby napisać nową funkcję:

> form <- ~s(x0)+s(x1)+s(x2)+s(x3) 
> form 
~s(x0)+s(x1)+s(x2)+s(x3) 
> update.formula(form, z ~ .) 
z ~ s(x0) + s(x1) + s(x2) + s(x3) 
+0

Dzięki, Derek, nie wiedziałem, że ta funkcja istnieje. –

+0

@MariusHofert Wydaje mi się, że ta odpowiedź jest bardziej elegancka niż obecnie akceptowana. Czy mógłbyś ponownie rozważyć przyjęcie? – Andrie

4

kludgy ale to działa:

form1 <- as.formula("hi ~ lo + mid") 
form2 <- as.formula("blue ~ red + green") 
form2[[3]] <- form1[[3]] 
> form2 
blue ~ lo + mid 
+0

Cóż, jak pisałem, I * nie * chcesz użyć 'as.formula()' i struny, to po prostu zła praktyka. Dzięki i tak. –

+0

@MariusHofert - czy możesz wyjaśnić, jaka jest zła praktyka dotycząca 'as.formula()'? – Chase

+0

Formuła jest formułą - i powinna być traktowana jako taka. Konwersja do/traktowanie go za pomocą łańcuchów jest złą praktyką. Zwróć uwagę, że zalecane podejście do budowania funkcji za pomocą formuł jest traktowane tutaj: http://developer.r-project.org/model-fitting-functions.txt Dwa dobre przykłady, które * nie * obejmują ciągi (a więc nie wymagają 'as.formula()') to funkcje 'lm()' i '(mgcv: :) gam'. –

5

Oto budynek wersja na pomysł @ GSK3 za:

changeLHS <- function(formula, lhs) { 
    if (length(formula) == 2) { 
    formula[[3]] <- formula[[2]] 
    } 
    formula[[2]] <- substitute(lhs) 
    formula 
} 

changeLHS(a~b+c, z+w) # z + w ~ b + c 
changeLHS(~b+c, z+w) # z + w ~ b + c 

Więc kod staje:

gamFitter <- function(formula.RHS, data, ...){ 
    frm <- changeLHS(formula.RHS, 2*y + f0) 
    gam(frm, data=data, ...) # call gam() 
} 
+0

* Nice *, thanks. Domyślam się, że 'rhs' powinno być' lhs' w 'changeLHS', aby było bardziej zrozumiałe, ale zdecydowanie działa dobrze. –

+0

@MariusHofert - Dobra uwaga, zmieniłem to. Teraz pozostała "prawa strona", prawda? ;-) – Tommy

0

Opierając się na innych odpowiedzi, jeśli trzeba wymienić LHS programmatically by passing strings (a la reformulate), następnie dwa małe szczypie może pomóc.

Korzystanie @ podejścia Tommy'ego:

changeLHS <- function(formula, lhs) { 
    if (length(formula) == 2) { 
     formula[[3]] <- formula[[2]] 
    } 
    formula[[2]] <- as.symbol(lhs) 
    formula 
} 

form <- ~s(x0)+s(x1)+s(x2)+s(x3) 
changeLHS(form, "z") 
## z ~ s(x0) + s(x1) + s(x2) + s(x3) 

Korzystanie @ podejścia Dereka:

update(form, reformulate(".", "z")) 
## z ~ s(x0) + s(x1) + s(x2) + s(x3) 
Powiązane problemy