Używam dołączonej funkcji obrazu w R. Wolę używać tego jako przeciwstawiania się mapie termicznej dla prędkości, ponieważ używam jej dla ogromnych macierzy (~ 400000 na 400).Funkcja obrazu R w R
Problemem w mojej funkcji jest zakres dynamiki palety kolorów, jedyny niebieski i żółty w moim przypadku. Próbowałem kilku zmian w linii colorramp, ale żadna nie dała mi pożądanego wyniku.
Ostatnia opcja Rampa kolor Próbowałem używał piękny pakiet R w nazwie ColorRamps, które dają dobre efekty to:
library("colorRamps")
ColorRamp = blue2green2red(400)
ColorLevels <- seq(min, max, length=length(ColorRamp))
Jednak nadal nie jest tak elastyczny jak opcje kolorów ziemi Matlab.
Nie bardzo wiem, jak sprawić, by wyglądał lepiej i miał większy zasięg, na przykład na załączonym zdjęciu.
Proszę poinformować mnie, czy można zmienić funkcję obrazu, aby wyglądał jak obraz na zdjęciu.
Funkcja R używam do kreślenia obrazów, z rastrem = TRUE dla prędkości jest następujący:
# ----- Define a function for plotting a matrix ----- #
myImagePlot <- function(x, filename, ...){
dev = "pdf"
#filename = '/home/unix/dfernand/test.pdf'
if(dev == "pdf") { pdf(filename, version = "1.4") } else{}
min <- min(x)
max <- max(x)
yLabels <- rownames(x)
xLabels <- colnames(x)
title <-c()
# check for additional function arguments
if(length(list(...))){
Lst <- list(...)
if(!is.null(Lst$zlim)){
min <- Lst$zlim[1]
max <- Lst$zlim[2]
}
if(!is.null(Lst$yLabels)){
yLabels <- c(Lst$yLabels)
}
if(!is.null(Lst$xLabels)){
xLabels <- c(Lst$xLabels)
}
if(!is.null(Lst$title)){
title <- Lst$title
}
}
# check for null values
if(is.null(xLabels)){
xLabels <- c(1:ncol(x))
}
if(is.null(yLabels)){
yLabels <- c(1:nrow(x))
}
layout(matrix(data=c(1,2), nrow=1, ncol=2), widths=c(4,1), heights=c(1,1))
# Red and green range from 0 to 1 while Blue ranges from 1 to 0
ColorRamp <- rgb(seq(0,1,length=256), # Red
seq(0,1,length=256), # Green
seq(1,0,length=256)) # Blue
ColorLevels <- seq(min, max, length=length(ColorRamp))
# Reverse Y axis
reverse <- nrow(x) : 1
yLabels <- yLabels[reverse]
x <- x[reverse,]
# Data Map
par(mar = c(3,5,2.5,2))
image(1:length(xLabels), 1:length(yLabels), t(x), col=ColorRamp, xlab="",
ylab="", axes=FALSE, zlim=c(min,max), useRaster=TRUE)
if(!is.null(title)){
title(main=title)
}
# Here we define the axis, left of the plot, clustering trees....
#axis(BELOW<-1, at=1:length(xLabels), labels=xLabels, cex.axis=0.7)
# axis(LEFT <-2, at=1:length(yLabels), labels=yLabels, las= HORIZONTAL<-1,
# cex.axis=0.7)
# Color Scale (right side of the image plot)
par(mar = c(3,2.5,2.5,2))
image(1, ColorLevels,
matrix(data=ColorLevels, ncol=length(ColorLevels),nrow=1),
col=ColorRamp,
xlab="",ylab="",
xaxt="n", useRaster=TRUE)
layout(1)
if(dev == "pdf") {
dev.off() }
}
# ----- END plot function ----- #
po prostu przeskaluj te do efektywnego kreślenia, to o wiele za dużo szczegółów dla obrazu – mdsumner