Usuwanie NA w dplyr pipe

Question

Próbowałem usunąć NA z podzbioru za pomocą dplyr piping. Czy moja odpowiedź jest oznaką pominiętego kroku? Próbuję dowiedzieć się, jak napisać funkcje za pomocą dplyr:

> outcome.df%>% 
+ group_by(Hospital,State)%>% 
+ arrange(desc(HeartAttackDeath,na.rm=TRUE))%>% 
+ head() 
Source: local data frame [6 x 5] 
Groups: Hospital, State 

 
          Hospital State HeartAttackDeath 
1  ABBEVILLE AREA MEDICAL CENTER SC    NA 
2  ABBEVILLE GENERAL HOSPITAL LA    NA 
3  ABBOTT NORTHWESTERN HOSPITAL MN    12.3 
4 ABILENE REGIONAL MEDICAL CENTER TX    17.2 
5  ABINGTON MEMORIAL HOSPITAL PA    14.3 
6 ABRAHAM LINCOLN MEMORIAL HOSPITAL IL    NA 
Variables not shown: HeartFailureDeath (dbl), PneumoniaDeath 
    (dbl) 

Answer 1

Nie sądzę desc bierze na.rm argumentu ... Jestem naprawdę zaskoczony, że nie wygeneruje błąd, kiedy daj mu jeden. Jeśli chcesz tylko usunąć NA, skorzystaj na.omit:

outcome.df %>% 
    na.omit() %>% 
    group_by(Hospital, State) %>% 
    arrange(desc(HeartAttackDeath)) %>% 
    head() 

Jeśli chcesz tylko usunąć NA s z kolumny HeartAttackDeath, filtr z is.na:

outcome.df %>% 
    filter(!is.na(HeartAttackDeath)) %>% 
    group_by(Hospital, State) %>% 
    arrange(desc(HeartAttackDeath)) %>% 
    head() 

Jak wskazano w dupe, Można również użyć complete.cases, ale nieco trudniej jest wstawić łańcuch, ponieważ przyjmuje on ramkę danych jako argument, ale zwraca wektor indeksu. Możesz więc użyć go tak:

outcome.df %>% 
    filter(complete.cases(.)) %>% 
    group_by(Hospital, State) %>% 
    arrange(desc(HeartAttackDeath)) %>% 
    head()