Jak profilować kod R z kodem SNOW

Question

Mam zagnieżdżoną pętlę, do której używam foreach, DoSNOW i klaster SNOW do rozwiązania. Jak mam profilować kod, aby upewnić się, że nie robię czegoś rażąco nieefektywnego?

Czy istnieje również sposób pomiaru przepływów danych między modułem głównym a węzłami w klastrze Snow?

Dzięki,

James

Answer 1

To jest doskonałe pytanie. Z góry głowę, zacznij od porównania

• roztwór seryjny (bez śniegu),
• seryjny rozwiązanie ze śniegiem (aby zorientować się, narzut) i
• rozwiązanie równoległego może kontrolowanie N, aby zobaczyć, jaki wzrost dostaniesz.

Wersja CRAN, która nigdy nie została wydana na wersję 0.3.4 z snow, ma również dodatkowe polecenia do drukowania, które są przydatne do analizy. Możesz go uzyskać od this directory at Luke Tierney's site.

Rzeczywiste profilowanie to oczywiście twardy ze względu na rozproszony charakter.