kontrolujący krawędzie widoczne na wykresie sieci w igraph w R

Question

że ma następujący schemat utworzony w igraph

set.seed(1410) 
df<-data.frame(
"site.x"=c(rep("a",4),rep("b",4),rep("c",4),rep("d",4)), 
"site.y"=c(rep(c("e","f","g","h"),4)), 
"bond.strength"=sample(1:100,16, replace=TRUE)) 

library(igraph) 
df<-graph.data.frame(df) 
V(df)$names <- c("a","b","c","d","e","f","g","h") 
layOUT<-data.frame(x=c(rep(1,4),rep(2,4)),y=c(4:1,4:1)) 
E(df)[ bond.strength < 101 ]$color <- "red" 
E(df)[ bond.strength < 67 ]$color <- "yellow" 
E(df)[ bond.strength < 34 ]$color <- "green" 
V(df)$color <- "white" 
l<-as.matrix(layOUT) 
plot(df,layout=l,vertex.size=10,vertex.label=V(df)$names, 
edge.arrow.size=0.01,vertex.label.color = "black") 

że chce pokazać wszystkie wierzchołki/węzłów ale tylko krawędzi, gdzie bond.strength> 34 (tj. tylko czerwone i żółte krawędzie). mogę kontrolować tego poprzez ustawienie bond.strength < 34 do bieli, ale nie jest całkiem, gdy odbywa się na moich rzeczywistych danych ustawiony jako białe brzegi „przeciąć” pozostałe krawędzie tj

Czy istnieje inny sposób po prostu kontrolować, które krawędzie są widoczne, pokazując wszystkie wierzchołki? Dzięki

Answer 1

Zastanawiam się, co się dzieje, jeśli ustawić kolor linii, aby być przejrzyste, coś jak:

E(df)[ bond.strength < 34 ]$color <- "#FF000000" 

I ugotował tę liczbę kolorów z:

hsv(1,1,1,alpha=0) 

Alternatywnie, można wejdź do środka i pomiń je ze swojego edgelisty.