2013-05-15 16 views
5

Próbowałem zainstalować RcppEigen na Amazon EC2 (na t1.micro do upewnij się, że działa) & ubuntu 13.04. Próbowałem z obu wersji R był 2.15.2 i 3.0, 32bit ubuntu i 64bit unbuntu. Za każdym razem otrzymałem:Błąd podczas instalacji RcppEigen na Amazon ec2

[email protected]:/home/ubuntu# R CMD INSTALL RcppEigen_0.3.1.2.1.tar.gz 
* installing to library ‘/usr/local/lib/R/site-library’ 
* installing *source* package ‘RcppEigen’ ... 
** package ‘RcppEigen’ successfully unpacked and MD5 sums checked 
** libs 
g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I"/usr/local/lib/R/site-library/Rcpp/include" -I../inst/include -fpic -O2 -pipe -g -c RcppEigen.cpp -o RcppEigen.o 
g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I"/usr/local/lib/R/site-library/Rcpp/include" -I../inst/include -fpic -O2 -pipe -g -c fastLm.cpp -o fastLm.o 
g++: internal compiler error: Killed (program cc1plus) 
Please submit a full bug report, 
with preprocessed source if appropriate. 
See <file:///usr/share/doc/gcc-4.7/README.Bugs> for instructions. 
make: *** [fastLm.o] Error 4 
ERROR: compilation failed for package ‘RcppEigen’ 
* removing ‘/usr/local/lib/R/site-library/RcppEigen’ 

Ktoś ma pomysł, w jaki sposób uzyskać RcppEigen do uruchomienia na EC2? (Rcpp instaluje bezbłędnie ...)

Odpowiedz

7

To wygląda na "prosty" problem z brakującą pamięcią.

C++ może wymagać tak jak jest, a skomplikowany kod szablonu (który z pewnością jest Eigen) wymaga jeszcze większej ilości zasobów. Po prostu spróbuj przydzielić więcej pamięci - w przeciwnym razie trudno jest zabić g++.

+0

działa idealnie! – user189035

+1

Miło to słyszeć! Myślę, że to było wcześniej. Może powinienem dodać go do FAQ for Rcpp ... –