Zmienna ekspansja komentarzy

Question

Czy możliwe jest rozszerzenie zmiennych w komentarzach wewnątrz skryptu bash?

Chcę napisać skrypt, który zostanie dodany do SGE. Składnia qsub pozwala mi przekazywać dodatkowe parametry do silnika siatki za pomocą linii wewnątrz skryptu bash, zaczynając od #$. Na przykład,

#$ -q all.q 
#$ -S /bin/bash 
#$ -V 
#$ -m beas 
#$ -o run_20120103.out 

Co chcę jest, że parametr -o dynamicznie ustawić zmienną, powiedzmy $1. Więc ja naiwnie napisać

#$ -o run_${1}.out 

Jednak ponieważ linia zaczyna się #, bash ignoruje go i zmienna $1 nie jest rozwinięty.

Wszelkie pomysły? Jakiś preprocesor bash? W jakiś inny sposób?

EDYCJA Jako przykład wybrałem $1. Równie dobrze może być $FOO lub $BAR.

Answer 1

Zmienna rozbudowa dzieje się w pamięci powłoki, nie ma wpływu na plik. Dlatego nie ma znaczenia, co rozszerzy się bash.

Zamiast tego prawdopodobnie można wygenerować skrypt do uruchomienia na bieżąco ze wszystkim rozwiniętym w lokalu:

cat << EOF | qsub [options] - 
#$ -o run_$1.out 
cmds 
EOF 

Answer 2

się być nieco bardziej SGE specyficzny niż zaakceptowanej odpowiedzi, po prostu przekierować standardowe wyjście qsub i przeanalizuj identyfikator zadania. Następnie możesz użyć tej opcji, aby zmienić nazwę zadania poprzez qalter.

Oto przykład skryptu, którego użyłem do przesłania i zmodyfikowania takich zadań.

for a in $args; 
do 
    qsub submission_script $a 1> job.txt 
    jid=$(cat job.txt | tr -dc '0-9' | cut -c -6) 
    qalter $jid -N $a 
done 

Jestem pewien, że istnieją bardziej idiomatyczne sposoby, aby to zrobić, ale to jest pierwsze podejście.

Takie podejście pozwala submission_script na posiadanie własnych argumentów. Pozwala także programowo zmieniać inne cechy pracy, a nie tylko nazwę.

Answer 3

Używam również polecenia qsub w SGE do generowania różnych raportów wyjściowych lub błędów. Na przykład, jeśli chciałbym obejmują TASK_ID w skrypcie, zamiast robić

#$ -o run_${TASK_ID}.out 

zapisać go bez paretheses rade:

#$ -o run_$TASK_ID.out