2014-12-04 13 views
6

Mam wykres działki 3 wiersze po 5 kolumnach. W każdym wierszu wyświetlane są dane rozłożone w różnych zakresach. Aby poprawnie wyświetlać moje dane, aby wszystko było pokazane, nie ustawiam limitu osi Y.Zmiana limitów osi Y dla każdego wiersza wykresu aspektu w ggplot2

Oto mój kod:

require(reshape2) 
library(ggplot2) 
library(RColorBrewer) 

fileName = paste("./data_test.csv", sep = "") 

## data available here: https://dl.dropboxusercontent.com/u/73950/data_test.csv 

mydata = read.csv(fileName,sep=",", header=TRUE) 

dataM = melt(mydata,c("id")) 
dataM = cbind(dataM, 
      colsplit(dataM$variable, 
        pattern = "_", 
        names = c("Network_model", "order", "category"))) 
dataM$variable <- NULL 
dataM <- dcast(dataM, ... ~ category, value.var = "value") 
dataM$minCut <- NULL 
dataM$nbr_communities <- NULL 
dataM$mean_community_size <- NULL 
dataM$density <- NULL 

my_palette <- colorRampPalette(rev(brewer.pal(11, "Spectral"))) 

dataM = melt(dataM, id.vars = c("Network_model", "order", "nodesRemoved", "id")) 

my_palette = c(brewer.pal(5, "Blues")[c(4)], brewer.pal(5, "Set1")[c(3)]) 

ggplot(dataM, aes(x= nodesRemoved ,y= value, group= order, color= order)) + 
    geom_point(size = .6,alpha = .15,position="jitter") + ## increased size 
    stat_smooth(se = FALSE, size = .5, alpha = .1, method = "loess") + 
    scale_color_manual(values=my_palette) + 
    theme_bw() + 
    theme(plot.background = element_blank(), 
     axis.line = element_blank(), 
     legend.key = element_blank(), 
     legend.title = element_blank(), 
     axis.text.x = element_text(size = 8), 
     axis.text.y = element_text(size = 8) 
     ) + 
    scale_y_continuous("Value") + 
    scale_x_continuous("Time", limits=c(0, 100)) + 

    facet_grid(variable ~ Network_model,scales="free") 

która produkuje ten:

enter image description here

Teraz chciałbym selektywnie ustalone limity dla każdej z trzech rzędach, tak, że pierwszy wiersz jest wartością graniczną = c (1,9, 3), druga to wartości graniczne = c (0, 1), a trzecia to wartości graniczne = c (.3, .7).

Jak mogę to osiągnąć w ggplot2 z faceting?

+1

może to być możliwe z aspektów, ale to nie będzie łatwe. Gdybym był tobą, zrobiłbym trzy ggplots, po jednym dla każdego rzędu. Następnie możesz ustawić ograniczenia osi y w sposób konwencjonalny, a następnie przykleić wiersze razem z np. 'Grid.arrange'. (Wątpię, że dostaniesz jakiekolwiek odpowiedzi z kodem, chyba że sprawisz, że twój przykład będzie odtwarzalny.) – Gregor

+1

Chociaż, jeśli jesteś w porządku z 'ggplot' ustawiającym limity, spróbuj' scales = "free_y" ', a nie' scale = "wolny" '. Nie widząc twoich danych, nie możesz odgadnąć, czy tego właśnie szukasz. – Gregor

+0

Dzięki Gregor, dodałem zbiór danych i pełny kod! Twoje zdrowie! – Rodolphe

Odpowiedz

3

Myślę, że najlepszą opcją będzie przycięcie danych przed ich naniesieniem, np. z dplyr,

library(dplyr) 
limits <- data.frame(variable = levels(dataM$variable), 
        min = c(1.9,0,0.3), 
        max = c(3,1,0.7)) 
dataC <- inner_join(dataM, limits) %>% filter(value > min, value < max) 

last_plot() %+% dataC 

enter image description here

(ja początkowo punkty większy zobaczyć winowajców bardziej czytelnie)

+0

Fantastyczny, działa świetnie, dzięki tak wielu Baptystów! – Rodolphe

Powiązane problemy