Porównywanie wierszy między dwiema macierzami

Question

Czy istnieje szybki sposób na znalezienie, które wiersze w macierzy A występują w macierzy B? np.

m1 = matrix(c(1:6), ncol=2, byrow = T); m2 = matrix(c(1:4), ncol=2, byrow=T); 

a wynik wynosi 1, 2

Matryce nie mają taką samą liczbę rzędów (liczba kolumn jest takie samo), i są one dość duże - od 10^6 - 10^7 liczba rzędów.

Najszybszy sposób z tym, że wiem teraz, to:

duplicated(rbind(m1, m2)) 

Tnx!

Answer 1

Szybkim sposobem dla tej wielkości powinno być:

require(data.table) 
M1 = setkey(data.table(m1)) 
M2 = setkey(data.table(m2)) 
na.omit(
    M2[M1,which=TRUE] 
) 
[1] 1 2 

Answer 2

Stworzyłem tę funkcję, która zwróci oryginalny identyfikator. Na przykład chcesz dopasować macierz x do macierzy y, zwróci ona identyfikator dopasowania y.

rowiseMatch2 <- function(x,y){ 
    require(data.table) 
    keycols <- colnames(x) 
    x <- cbind(x, id=1:nrow(x)) 
    y <- cbind(y, id=1:nrow(y)) 
    m1 = data.table(x) 
    setkeyv(m1, keycols) 
    m2 = data.table(y) 
    setkeyv(m2, keycols) 
    m1id <- m1$id 
    m2id <- m2$id 

    m1$id <- NULL 
    m2$id <- NULL 

    m <- na.omit(m2[m1,which=TRUE]) 
    mo <- m2id[m][order(m1id)] 

    if(length(mo) == nrow(x)){ 
    cat("Complete match!\n") 
    }else{ 
    cat("Uncomplete match, match percentage is:", round(length(mo)/nrow(x), 4)*100, "%\n") 
    } 
    return(as.integer(mo)) 
}