logarytmiczne kosze na osi y w Pythonie

Question

Próbuję utworzyć histogram kolumny danych i wykreślić go logarytmicznie (y-axis) i nie jestem pewien, dlaczego następujący kod nie działa:

import numpy as np 
import matplotlib.pyplot as plt 
data = np.loadtxt('foo.bar') 
fig = plt.figure() 
ax = fig.add_subplot(111) 
plt.hist(data, bins=(23.0, 23.5,24.0,24.5,25.0,25.5,26.0,26.5,27.0,27.5,28.0)) 
ax.set_xlim(23.5, 28) 
ax.set_ylim(0, 30) 
ax.grid(True) 
plt.yscale('log') 
plt.show() 

Próbowałem również zamiast plt.yscale('log') dodając Log=true w linii plt.hist, a także próbowałem ax.set_yscale('log'), ale nic nie działa. Albo dostaję pustą działkę, albo y-axis jest rzeczywiście logarytmiczna (z kodem jak pokazano powyżej), ale nie ma danych naniesionych na wykres (bez skrzynek).

Answer 1

spróbować

plt.yscale('log', nonposy='clip') 

http://matplotlib.org/api/pyplot_api.html#matplotlib.pyplot.yscale

Problem jest z dolnej części prętów będących przy y = 0 i domyślnie jest do maskowania w nieważnej punktów (log(0) -> niezdefiniowany), gdy robi log transformacja (była dyskusja na temat zmiany tego, ale nie pamiętam, w którą stronę poszła), więc kiedy próbuje narysować prostokąty dla twojego wykresu słupkowego, dolna krawędź jest maskowana -> brak prostokątów.

Answer 2

np.logspace zwraca kosze w [1-10], logarytmicznie rozmieszczone - w moim przypadku xx to npvector> 0 więc następujący kod załatwia sprawę

logbins=np.max(xx)*(np.logspace(0, 1, num=1000) - 1)/9 
hh,ee=np.histogram(xx, density=True, bins=logbins)