2010-01-10 14 views
6

Czy ktoś ma dobre oprogramowanie/samouczek dotyczący symulacji inżynierii genetycznej? Może oprogramowanie open source o symulacji łączenia/klonowania genu?Symulacja inżynierii genetycznej

Dzięki

+0

Przypuszczam, że zawsze mogę zacząć od http://www.amazon.com/s/ref=nb_ss?url=search-alias%3Daps&field-keywords=genetic+simulation&x=0&y=0 – portoalet

Odpowiedz

0

To nie może być dokładnie to, co jesteś po, ale masz spojrzał na Spore?

Jest całkiem możliwe, że nie ma czegoś takiego jak "poważne" oprogramowanie do symulacji inżynierii genetycznej. Myślę, że byłoby to bardzo trudne do zrealizowania.

+1

W rzeczywistości były współpracownik w Queen Elizabeth College, University of London, napisał dość kompletny symulator inżynierii genetycznej bakterii (siekanie i splatanie) na drodze Commodore PET na początku lat 80. Nie mam zielonego pojęcia, co się z nim stało, ale wyobrażam sobie, że w dzisiejszych czasach można było zrobić o wiele lepiej. –

+0

Ja się poprawiam. Dziękuję Ci! –

0

Doskonałe pytanie!

Niewątpliwie inżynieria genetyczna nie może być symulowana na poziomie analitycznym - tj. modelowanie zaangażowanego mechanizmu - ponieważ niektóre procesy, takie jak zwijanie białek, transkrypcja DNA itp., są zbyt złożone i nie zostały jeszcze modelowane.

Nadal pracują nad mapą ludzkiego genomu i jestem pewna, że ​​nie doszły do ​​niczego innego, ponieważ wszystko o rozsądnej złożoności nie jest o wiele mniej złożone (pod względem liczby genów) od człowieka. Na przykład możesz zaoszczędzić 2% na złożoności, ale wtedy masz szympansa, a nie człowieka.

Możliwe są jednak podejścia oparte na metodach empirycznych - tj. Metodach "najlepszego odgadnięcia" lub eksperymentowaniu. W związku z tym możesz przyjrzeć się niedawnym pracom nad uczeniem maszynowym lub eksploracją danych dla niektórych możliwych podejść. Istnieje wiele metod data mining i uczenia maszynowego tam, począwszy od algorytmy genetyczne, sieci neuronowe, drzewa decyzyjne, SVM itp

http://en.wikipedia.org/wiki/Data_mining

http://en.wikipedia.org/wiki/Machine_learning